O médico pediatra gastroenterologista cuida das alterações digestivas, como alergia à proteína do leite de vaca, intolerância à lactose, doença celíaca, constipação intestinal, dor abdominal, refluxo gastroesofágico, esofagite, gastrite, doença inflamatória intestinal e distúrbio do crescimento, entre outras. Também orienta a família sobre alimentação, crescimento e desenvolvimento da criança.